Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dap3Q9ER88 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dap3Q9ER88 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dap3Q9ER88 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dap3Q9ER88 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dap3Q9ER88 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms