Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tor1bQ9ER41 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tor1bQ9ER41 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tor1bQ9ER41 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tor1bQ9ER41 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tor1bQ9ER41 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tor1bQ9ER41 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tor1bQ9ER41 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tor1bQ9ER41 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tor1bQ9ER41 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tor1bQ9ER41 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tor1bQ9ER41 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tor1bQ9ER41 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms