Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhox9Q9EQM5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhox9Q9EQM5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox9Q9EQM5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhox9Q9EQM5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhox9Q9EQM5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox9Q9EQM5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms