Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pold3Q9EQ28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pold3Q9EQ28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pold3Q9EQ28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pold3Q9EQ28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pold3Q9EQ28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pold3Q9EQ28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pold3Q9EQ28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pold3Q9EQ28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pold3Q9EQ28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pold3Q9EQ28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pold3Q9EQ28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pold3Q9EQ28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pold3Q9EQ28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pold3Q9EQ28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pold3Q9EQ28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pold3Q9EQ28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms