Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r53Q9EP93 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r53Q9EP93 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r53Q9EP93 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r53Q9EP93 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r53Q9EP93 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r53Q9EP93 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r53Q9EP93 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r53Q9EP93 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r53Q9EP93 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r53Q9EP93 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r53Q9EP93 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r53Q9EP93 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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