Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr4Q9EP82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr4Q9EP82 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Wdr4Q9EP82 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr4Q9EP82 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Wdr4Q9EP82 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr4Q9EP82 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr4Q9EP82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Wdr4Q9EP82 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr4Q9EP82 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr4Q9EP82 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr4Q9EP82 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr4Q9EP82 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr4Q9EP82 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms