Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsc1Q9EP53 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsc1Q9EP53 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsc1Q9EP53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsc1Q9EP53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsc1Q9EP53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsc1Q9EP53 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsc1Q9EP53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsc1Q9EP53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tsc1Q9EP53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsc1Q9EP53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms