Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc38a3Q9DCP2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc38a3Q9DCP2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc38a3Q9DCP2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a3Q9DCP2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a3Q9DCP2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms