Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcaQ9DC61 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PmpcaQ9DC61 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PmpcaQ9DC61 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PmpcaQ9DC61 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmpcaQ9DC61 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PmpcaQ9DC61 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmpcaQ9DC61 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PmpcaQ9DC61 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms