Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cbx6Q9DBY5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cbx6Q9DBY5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cbx6Q9DBY5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cbx6Q9DBY5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cbx6Q9DBY5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cbx6Q9DBY5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cbx6Q9DBY5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cbx6Q9DBY5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms