Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd2Q9DBX3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Susd2Q9DBX3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd2Q9DBX3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd2Q9DBX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd2Q9DBX3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms