Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
March8Q9DBD2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
March8Q9DBD2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
March8Q9DBD2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
March8Q9DBD2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
March8Q9DBD2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
March8Q9DBD2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
March8Q9DBD2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
March8Q9DBD2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms