Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap1s2Q9DB50 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap1s2Q9DB50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap1s2Q9DB50 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap1s2Q9DB50 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap1s2Q9DB50 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap1s2Q9DB50 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ap1s2Q9DB50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap1s2Q9DB50 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap1s2Q9DB50 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap1s2Q9DB50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms