Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim23Q9DAL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smim23Q9DAL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim23Q9DAL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim23Q9DAL0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim23Q9DAL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms