Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem239Q9DA47 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem239Q9DA47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem239Q9DA47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms