Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9DA42 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9DA42 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9DA42 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9DA42 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9DA42 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9DA42 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9DA42 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9DA42 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9DA42 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9DA42 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9DA42 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9DA42 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9DA42 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9DA42 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9DA42 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9DA42 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9DA42 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9DA42 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9DA42 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9DA42 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9DA42 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9DA42 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9DA42 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9DA42 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9DA42 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9DA42 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9DA42 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9DA42 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9DA42 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9DA42 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9DA42 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9DA42 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9DA42 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9DA42 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9DA42 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9DA42 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9DA42 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9DA42 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9DA42 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9DA42 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9DA42 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9DA42 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9DA42 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9DA42 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9DA42 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9DA42 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9DA42 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9DA42 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9DA42 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9DA42 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9DA42 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9DA42 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9DA42 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9DA42 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9DA42 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9DA42 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9DA42 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9DA42 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9DA42 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9DA42 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9DA42 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9DA42 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9DA42 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9DA42 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9DA42 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9DA42 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9DA42 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9DA42 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9DA42 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9DA42 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9DA42 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9DA42 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9DA42 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9DA42 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9DA42 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9DA42 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9DA42 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9DA42 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9DA42 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9DA42 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9DA42 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9DA42 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9DA42 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9DA42 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9DA42 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9DA42 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9DA42 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9DA42 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9DA42 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9DA42 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9DA42 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9DA42 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9DA42 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9DA42 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9DA42 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9DA42 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9DA42 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9DA42 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9DA42 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms