Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Subh2bvQ9D9Z7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Subh2bvQ9D9Z7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Subh2bvQ9D9Z7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Subh2bvQ9D9Z7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms