Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9R3

Spata9, Spermatogenesis-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata9Q9D9R3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spata9Q9D9R3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spata9Q9D9R3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata9Q9D9R3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata9Q9D9R3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata9Q9D9R3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata9Q9D9R3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spata9Q9D9R3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spata9Q9D9R3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spata9Q9D9R3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spata9Q9D9R3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Spata9Q9D9R3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spata9Q9D9R3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spata9Q9D9R3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spata9Q9D9R3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Spata9Q9D9R3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spata9Q9D9R3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spata9Q9D9R3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spata9Q9D9R3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spata9Q9D9R3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spata9Q9D9R3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Spata9Q9D9R3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spata9Q9D9R3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spata9Q9D9R3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spata9Q9D9R3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spata9Q9D9R3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spata9Q9D9R3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms