Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bpifa3Q9D9J8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bpifa3Q9D9J8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bpifa3Q9D9J8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Bpifa3Q9D9J8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bpifa3Q9D9J8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bpifa3Q9D9J8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms