Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Borcs5Q9D920 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Borcs5Q9D920 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Borcs5Q9D920 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Borcs5Q9D920 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Borcs5Q9D920 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms