Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erp27Q9D8U3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Erp27Q9D8U3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erp27Q9D8U3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Erp27Q9D8U3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erp27Q9D8U3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erp27Q9D8U3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erp27Q9D8U3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erp27Q9D8U3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erp27Q9D8U3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erp27Q9D8U3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms