Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8L0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D8L0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8L0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8L0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8L0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8L0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D8L0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8L0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D8L0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8L0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8L0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8L0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8L0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8L0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8L0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8L0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8L0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8L0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8L0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8L0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8L0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8L0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms