Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AplfQ9D842 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AplfQ9D842 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AplfQ9D842 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AplfQ9D842 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AplfQ9D842 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AplfQ9D842 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AplfQ9D842 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AplfQ9D842 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AplfQ9D842 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AplfQ9D842 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AplfQ9D842 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AplfQ9D842 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AplfQ9D842 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AplfQ9D842 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AplfQ9D842 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AplfQ9D842 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AplfQ9D842 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AplfQ9D842 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AplfQ9D842 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AplfQ9D842 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AplfQ9D842 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AplfQ9D842 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AplfQ9D842 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms