Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Capn9Q9D805 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Capn9Q9D805 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn9Q9D805 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn9Q9D805 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Capn9Q9D805 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn9Q9D805 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn9Q9D805 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms