Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clic3Q9D7P7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clic3Q9D7P7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clic3Q9D7P7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clic3Q9D7P7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clic3Q9D7P7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic3Q9D7P7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms