Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrps9Q9D7N3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrps9Q9D7N3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrps9Q9D7N3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrps9Q9D7N3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrps9Q9D7N3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrps9Q9D7N3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrps9Q9D7N3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrps9Q9D7N3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mrps9Q9D7N3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrps9Q9D7N3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrps9Q9D7N3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrps9Q9D7N3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms