Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shisa5Q9D7I0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shisa5Q9D7I0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shisa5Q9D7I0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shisa5Q9D7I0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shisa5Q9D7I0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shisa5Q9D7I0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shisa5Q9D7I0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms