Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D7E4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D7E4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D7E4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D7E4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D7E4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D7E4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D7E4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D7E4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D7E4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D7E4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D7E4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D7E4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms