Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930449I24RikQ9D5E3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930449I24RikQ9D5E3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930449I24RikQ9D5E3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930449I24RikQ9D5E3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930449I24RikQ9D5E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms