Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zc2hc1bQ9D534 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zc2hc1bQ9D534 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zc2hc1bQ9D534 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc2hc1bQ9D534 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc2hc1bQ9D534 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc2hc1bQ9D534 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc2hc1bQ9D534 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc2hc1bQ9D534 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc2hc1bQ9D534 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms