Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam90a1bQ9D4F3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam90a1bQ9D4F3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam90a1bQ9D4F3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam90a1bQ9D4F3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam90a1bQ9D4F3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam90a1bQ9D4F3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms