Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
4933402E13RikQ9D4D2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4933402E13RikQ9D4D2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933402E13RikQ9D4D2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4933402E13RikQ9D4D2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933402E13RikQ9D4D2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933402E13RikQ9D4D2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4933402E13RikQ9D4D2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4933402E13RikQ9D4D2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4933402E13RikQ9D4D2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms