Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933425L06RikQ9D3Z8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933425L06RikQ9D3Z8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms