Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430402E10RikQ9D3N5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430402E10RikQ9D3N5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430402E10RikQ9D3N5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430402E10RikQ9D3N5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430402E10RikQ9D3N5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430402E10RikQ9D3N5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
5430402E10RikQ9D3N5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms