Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z1

Ceacam20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam20Q9D2Z1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ceacam20Q9D2Z1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam20Q9D2Z1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam20Q9D2Z1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ceacam20Q9D2Z1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam20Q9D2Z1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ceacam20Q9D2Z1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ceacam20Q9D2Z1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ceacam20Q9D2Z1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ceacam20Q9D2Z1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ceacam20Q9D2Z1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ceacam20Q9D2Z1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms