Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
4930583I09RikQ9D2E3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930583I09RikQ9D2E3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930583I09RikQ9D2E3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930583I09RikQ9D2E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930583I09RikQ9D2E3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930583I09RikQ9D2E3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms