Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam173bQ9D1Z3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam173bQ9D1Z3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam173bQ9D1Z3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam173bQ9D1Z3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam173bQ9D1Z3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam173bQ9D1Z3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam173bQ9D1Z3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam173bQ9D1Z3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms