Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl53Q9D1H8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl53Q9D1H8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mrpl53Q9D1H8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl53Q9D1H8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms