Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps28Q9D1C8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps28Q9D1C8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps28Q9D1C8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps28Q9D1C8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps28Q9D1C8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps28Q9D1C8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms