Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B8

Dcdc2c, Doublecortin domain-containing protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2cQ9D1B8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dcdc2cQ9D1B8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dcdc2cQ9D1B8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcdc2cQ9D1B8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dcdc2cQ9D1B8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2cQ9D1B8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dcdc2cQ9D1B8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dcdc2cQ9D1B8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dcdc2cQ9D1B8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dcdc2cQ9D1B8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms