Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syf2Q9D198 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syf2Q9D198 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syf2Q9D198 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syf2Q9D198 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Syf2Q9D198 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syf2Q9D198 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syf2Q9D198 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms