Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ribc1Q9D0B8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ribc1Q9D0B8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ribc1Q9D0B8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ribc1Q9D0B8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ribc1Q9D0B8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ribc1Q9D0B8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ribc1Q9D0B8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ribc1Q9D0B8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ribc1Q9D0B8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 598.6 ms