Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssu72Q9CY97 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssu72Q9CY97 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssu72Q9CY97 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssu72Q9CY97 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssu72Q9CY97 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssu72Q9CY97 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssu72Q9CY97 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssu72Q9CY97 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssu72Q9CY97 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssu72Q9CY97 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms