Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exo5Q9CXP9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exo5Q9CXP9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exo5Q9CXP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exo5Q9CXP9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Exo5Q9CXP9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exo5Q9CXP9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms