Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
3300002I08RikQ9CXH3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
3300002I08RikQ9CXH3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
3300002I08RikQ9CXH3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
3300002I08RikQ9CXH3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
3300002I08RikQ9CXH3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms