Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RpainQ9CWY9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RpainQ9CWY9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RpainQ9CWY9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RpainQ9CWY9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RpainQ9CWY9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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