Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma8Q9CWH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psma8Q9CWH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Psma8Q9CWH6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psma8Q9CWH6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psma8Q9CWH6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psma8Q9CWH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms