Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atxn3Q9CVD2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atxn3Q9CVD2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atxn3Q9CVD2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atxn3Q9CVD2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atxn3Q9CVD2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atxn3Q9CVD2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atxn3Q9CVD2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atxn3Q9CVD2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Atxn3Q9CVD2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Atxn3Q9CVD2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atxn3Q9CVD2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atxn3Q9CVD2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atxn3Q9CVD2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atxn3Q9CVD2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atxn3Q9CVD2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atxn3Q9CVD2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atxn3Q9CVD2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms