Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smurf1Q9CUN6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smurf1Q9CUN6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf1Q9CUN6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf1Q9CUN6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf1Q9CUN6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smurf1Q9CUN6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smurf1Q9CUN6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smurf1Q9CUN6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smurf1Q9CUN6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smurf1Q9CUN6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smurf1Q9CUN6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smurf1Q9CUN6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smurf1Q9CUN6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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