Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sft2d3Q9CSV6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sft2d3Q9CSV6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sft2d3Q9CSV6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sft2d3Q9CSV6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sft2d3Q9CSV6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sft2d3Q9CSV6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms